Gołęń kapski nie jest gatunkiem zagrożonym. Wedle Czerwonej Listy Międzynarodowego Związku Ochrony Przyrody (IUCN) gołęń kapski sklasyfikowany jest jako „LC” (Least Concern – najmniejsze ryzyko). Oznacza to, że gatunek nie jest zagrożony wyginięciem, a jego populacja jest stabilna lub rośnie.