* Zmiany użytkowania gruntów: Orły potrzebują dużych, otwartych obszarów do gniazdowania i polowania. W miarę wzrostu populacji ludzkich obszary te są coraz częściej przekształcane w inne zastosowania, takie jak mieszkania, rolnictwo i rozwój komercyjny.
* Zanieczyszczenie: Orły mogą być zatrute przez zanieczyszczenia w powietrzu, wodzie i glebie. Zanieczyszczenia te mogą pochodzić z różnych źródeł, w tym emisji przemysłowych, spływu rolnictwa i wydechu pojazdu.
* polowanie i prześladowania: Orły są czasami zastrzelone lub zabijane dla sportu lub dlatego, że są postrzegane jako zagrożenie dla zwierząt gospodarskich lub gry.
* Fragmentacja siedliska: Fragmentacja siedlisk występuje, gdy ciągłe siedlisko zajmowane przez populację dzikiej przyrody jest podzielone na kawałki. Może to być spowodowane rozwojem gruntów, takim jak drogi i budynki lub zmiany naturalne, takie jak pożar. Fragmentowane siedlisko może utrudnić orłom podróżowanie i znalezienie jedzenia oraz może zmniejszyć jakość ich miejsc lęgowych.
* Zmiana klimatu: Cieplejsze i bardziej ekstremalne warunki pogodowe związane ze zmianami klimatu mogą również zagrozić siedlisku łysego orła. Rosnące poziomy morza mogą zaopatrywać przybrzeżne bagna, podczas gdy zwiększone pożary lasów i susze mogą zabić drzewa i niszczyć miejsca lęgowe.
* Zatrucie ołowiu: Łysy orły są również podatne na zatrucie ołowiu, które mogą wystąpić po spożyciu amunicji opartej na ołowie, sprzęt rybacki lub farby ołowiowej. Zatrucie ołowiu może powodować różnorodne problemy zdrowotne, w tym uszkodzenie mózgu, uszkodzenie nerek i śmierć.
* choroba: Orły są podatne na niektóre rodzaje chorób, takich jak wirus Zachodniego Nilu, który jest rozpowszechniony przez komary i często śmiertelne dla orłów.