Orły harpii to drapieżniki alfa na szczycie łańcucha pokarmowego. Ze względu na olbrzymi rozmiar i potężny lot nie mają naturalnych drapieżników poza ludźmi. Polują na duże ptaki, małpy, leniwce i drobne ssaki, pomagając utrzymać równowagę ekologiczną w swoich lasach deszczowych.