Jaja muchy domowej mają około 1 mm długości, są owalne i białe lub żółtawe. Samice zładają je w klastrach na ciepłych powierzchniach, takich jak obornik, śmieci lub jedzenie. Każda samica może złożyć do 100 jaj naraz, a one wykluwają się na larwy (robaki) w ciągu 24–48 godzin.