Ptaki należą do klasy Aves , charakteryzujący się piórami, dziobami i skrzydłami, podczas gdy nietoperze należą do rzędu Chiroptera, w klasie Mammalia . Nietoperze są jedynymi ssakami, które potrafią latać z napędem.
Nietoperze i ptaki mają wspólnego przodka , zwany Synapsydem, który istniał około 300 milionów lat temu. Od tego wspólnego przodka oddzieliły się dwie gałęzie:synapsydy, które wyewoluowały w ssaki, i zauropsydy, które dały początek gadom i ptakom.
Chociaż mogły mieć wspólnego przodka, nietoperze i ptaki wyewoluowały znaczące różnice w ich anatomii, fizjologii i zachowaniu na przestrzeni milionów lat.