Chromosom Y zawiera gen zwany genem SRY, który koduje białko, które jest niezbędne do rozwoju mężczyzn. Gen SRY znajduje się na krótkim ramieniu chromosomu Y i jest obecny u wszystkich mężczyzn, ale nie u kobiet.
Kiedy gen SRY jest włączony, wywołuje kaskadę zdarzeń, które prowadzą do rozwoju męskich narządów reprodukcyjnych. Zdarzenia te obejmują tworzenie jąder, produkcję testosteronu i różnicowanie zewnętrznych narządów płciowych w struktury męskie.
W przypadku braku genu sry zarodek rozwinie się w kobietę. Wynika to z faktu, że żeński układ reprodukcyjny jest domyślną ścieżką rozwojową dla zarodków. U kobiet jajniki rozwijają się i wytwarzają estrogen, a zewnętrzne narządy płciowe różnicują się w struktury żeńskie.