Border collie występuje w wielu kolorach i kombinacjach, w tym:
- Czarno-biały
- Niebiesko-biały (blue merle)
- Czerwono-biały
- Red merle
- Blue merle
- Tricolor (czarny, biały, rudawy)
- Sable (jednolity jasnobrązowy lub ciemnobrązowy)
Border collie z sierścią merle mogą mieć również białe łapy, biały opasek na klatce piersiowej i białe końcówki ogona.