Boksersy robią świetnych pupili, ale są skłonni do wielu problemów zdrowotnych, w tym potencjalnie śmiertelnych. Te problemy mogą zostać pogorszone, jeśli boksers nie dostaje wystarczająco dużo ćwiczeń lub je dietą, która nie jest wystarczająco odżywcza. Według Amerykańskiego Stowarzyszenia Ratownictwa Boksersów, jeden z powodów, dla których boksersy są porzucane w schroniskach dla zwierząt, to właściciele nie chcą radzić sobie z kosztami medycznymi.
Problemy serca
Według "Przewodnika Weterynarza po Zdrowiu Twojego Psa" (zobacz Zasoby), najczęstszymi problemami serca u boksersów są: stenoza aortalna (wada zaworu aortalnego) i anomalii przedsionkowe (wady komór serca).
Problemy z krzepnięciem krwi
Boksersy są skłonni do dwóch typów problemów z krzepnięciem krwi: niedobór czynnika II (gdzie krew nie krzepnie) i niedobór czynnika VII, gdzie boksers nie może wytworzyć chemikalia zwanego protrombina, czyniąc psa skłonnym do krwawień z nosa.
Problemy trawienne
Według Amerykańskiego Klubu Bokserskiego (zobacz Zasoby), boksersy są skłonne do puchnięcia (podobnego do koliki u koni), trzustki ostrej i stenozy pylorycznej (wady żołądka, gdzie otwór dla jedzenia jest zbyt mały).
Guzy mózgu
Kilka ras psów jest skłonnych do guzów mózgu, a boksers to jeden z nich. Objawy obejmują nierozpoznawanie nikogo, problemy z koordynacją i chodzenie w kółko.
Głuchota
Według "Przewodnika Weterynarza po Objawach Twojego Psa", wszystkie kolory boksersów są skłonne do głuchoty, ale dzieje się to głównie u białych lub w większości białych boksersów. Głuchota może być w jednym uchu lub w obu (zobacz Zasoby).