Utrata siedlisk
Te nietoperze polegają na jaskiniach i szczelinach skalnych jako miejscach noclegowych i hibernacji. Działalność ludzka, taka jak górnictwo, gospodarka leśna i urbanizacja, często zakłóca lub niszczy te kluczowe siedliska.
Pestycydy i trujące substancje
Chemikalia rolnicze i środki ochrony roślin mogą gromadzić się w organizmach nietoperzy, powodując problemy rozrodcze, wady wrodzone i śmierć.
Choroby
Biała plamka (white-nose syndrome), śmiertelna choroba grzybowa, zabiła miliony nietoperzy w Ameryce Północnej. Choć nie wykryto jej jeszcze u nietoperzy wielkouszych Townsenda, pozostaje poważnym zagrożeniem.
Polowanie i zbieranie
Nietoperze bywają polowane dla futra lub zbierane jako ciekawostki, co może zagładzić lokalne populacje.
Zmiany klimatyczne
Przesuwające się klimaty mogą zakłócać hibernację, zmniejszać odpowiednie miejsca noclegowe i zmieniać rozmieszczenie ofiar owadowych.
Ochrona pozostałych siedlisk, ograniczenie stosowania pestycydów i zapobieganie rozprzestrzenianiu się chorób to kluczowe kroki, by pomóc temu gatunkowi przetrwać.