Utrata i fragmentacja siedlisk :Jaguary do przetrwania wymagają rozległych terytoriów i różnorodnych siedlisk. Niestety ich naturalne siedliska szybko ulegają utracie i fragmentacji w wyniku wylesiania, rozwoju rolnictwa, rozwoju infrastruktury i rozwoju miast. To nie tylko zmniejsza dostępną przestrzeń do wędrówki jaguarów, ale także zakłóca ich wzorce rozmnażania, żerowania i migracji.
Konflikt człowiek-dzika :W miarę jak osiedla ludzkie rozszerzają się na siedliska jaguarów, pojawiają się konflikty, gdy jaguary polują na zwierzęta gospodarskie. Może to prowadzić do odwetu rolników i hodowców, a w rezultacie do zabijania jaguarów. Ponadto jaguary mogą zostać zabite, jeśli stanowią postrzegane zagrożenie dla bezpieczeństwa ludzi lub są postrzegane jako uciążliwe.
Zmiany klimatyczne :Skutki zmian klimatycznych, takie jak zmienione wzorce opadów, rosnące temperatury i zwiększona częstotliwość ekstremalnych zjawisk pogodowych, wpływają na siedliska jaguarów i populacje ofiar. Zmiany te zakłócają ekosystem i utrudniają jaguarom przetrwanie i pomyślne rozmnażanie się.
Ograniczona różnorodność genetyczna :Jaguary mają stosunkowo niską różnorodność genetyczną w porównaniu do innych gatunków dużych kotów. To czyni je bardziej podatnymi na skutki utraty siedlisk, polowań i innych czynników, które mogą zakłócać ich populację. Niska różnorodność genetyczna może zmniejszyć zdolność gatunku do przystosowania się do zmian środowiskowych i zwiększyć ryzyko chowu wsobnego.