Kolor koników dziczych mocno zależy od regionu i populacji. Mogą być: gniade, czarne, brązowe, kasztanowate, palomino, buckskin, dun, kremowe, perlinowe, siwe lub rumiane. Niektóre populacje mają unikalne wzory, np. mustangi Pinto. Kolory grzywa i ogona też się różnią – czarne, brązowe, blond.