Młode konie morskie, zwane też „młodkami” (fry), są niesamowicie drobne i mają bardzo specyficzną dietę. Są drapieżne i polegają na mikroskopowych organizmach zwanych zooplanktonem. Obejmuje to:
Kopépody: Drobne skorupiaki, które są powszechnym pokarmem dla wielu stworzeń morskich.
Rotatory (Rotifers): Mikroskopowe zwierzęta z kołowatą strukturą pomagającą im pływać.
Nauplie Artemia: Stadium larwalne raków solec, popularne źródło pokarmu dla młodych koni morskich.
W miarę jak młode konie morskie rosną, zaczynają spożywać większy zooplankton i ostatecznie przechodzą na dietę dorosłych, w tym małe skorupiaki, robaki, a nawet małe ryby.