Leczenie sarkoidów u koni zależy od wielkości, lokalizacji i typu guza. Częste metody: wycięcie chirurgiczne, kriochirurgia (zamrażanie), elektrokoagulacja, terapia laserowa, leki miejscowe, immunoterapia, terapia fotodynamiczna. Niektóre sarkoidy nie wymagają leczenia, inne – interwencji, by zapobiec nawotom lub upośledzeniom.
Dozwolony weterynarz koni powinien dobrać plan leczenia do indywidualnego stanu konia.