Minogowe morskie mają kilka naturalnych drapieżników w ekosystemach, które zamieszkują. Rybne drapieżniki to: trout jeziorny (lake trout), sieja (whitefish), szczupak północny (northern pike), okoń okończyk (muskellunge), sandacz (walleye).
Ptaki też polują na minogów: mewy, rybitwy, kormorany łapią je i jedzą, zwłaszcza w płytkich wodach lub podczas wędrówek tarławnych.
Oprócz drapieżników, minogi są narażone na różne pasożyty i choroby, które wpływają na ich zdrowie i wskaźniki przeżycia.