Dugongi to gatunek wrażliwy, ich zabijanie jest nielegalne w większości krajów. Zagrożenia: utrata siedlisk, zagarnięcie w sieci, zderzenia z łodziami, braconierstwo, zmiana klimatu. Przyczyny naturalne: drapieżność, choroby.
Ochrona skupia się na ratunku łąk morskich i przetrwaniu gatunku. WWF i Dugong and Seagrass Conservation Project działają na ich rzecz.