Rodzim krokodyla zależy od konkretnego gatunku. Najczęstsze rodziny krokodyli to:
- Crocodylus – prawdziwe krokodyle (np. krokodyl nilowy, krokodyl solny)
- Alligator – aligatorowie (np. aligator missisipijski, aligator chiński)
- Osteolaemus – krokodyl karłowy afrykański
- Caiman – kaimany (np. kaiman czarny, kaiman brzykowaty)
- Melanosuchus – kaiman czarny (czasami klasyfikowany jako osobny rodzim)
Warto pamiętać, że terminy „krokodyl”, „aligator” i „kaiman” są często używane zamiennie w potocznym języku, ale z punktu widzenia taksonomii oznaczają różne grupy.