Pustynne myszy to oportunistyczne wszystkożercy, jedzą to, co dostępne.
Pokarm roślinny
Nasiona, owoce, liście, korzenie i bulwy to główne źródło pożywienia.
Pokarm zwierzęcy
Owady, małe bezkręgowce, jajka ptaków i padlina. Niektóre gatunki jedzą też grzyby i ludzkie odchody żywności.
Konkretna dieta zależy od lokalizacji, pory roku i dostępności pożywienia.