Grzebieniowce są drapieżne i żywią się głównie zooplanktonem, małymi rybami, larwami ryb i innymi grzebieniowcami, w tym własnym gatunkiem. Łapią ofiary za pomocą grzbietów grzebieniastych, lepkich palców i wyspecjalizowanych komórek trawiennych zwanych koloblastami. Niektóre gatunki są kanibalskie.