Drapieżnik: Jako drapieżnik szczytowy, orzeł łysy pomaga regulować populacje ryb, zwłaszcza w sezonie rozrodu, zachowując równowagę w ekosystemach wodnych.
Padlinożerca: Orły łyse jedzą padliny pozostawione przez inne drapieżniki lub przyczyny naturalne, pomagając usuwać trupy i ograniczając rozprzestrzenianie chorób.
Inżynier ekosystemu: Ich duże gniazda dają schronienie i platformy gniazdowe innym gatunkom ptaków i zwierząt, pośrednio wspierając bioróżnorodność.
Wskaźnik ekologiczny: Orły łyse są gatunkiem wskaźnikowym. Spady populacji mogą sygnalizować zanieczyszczenie, degradację siedlisk lub zaburzenia w rybołówstwie.