Rozmnażanie: Kloaka przekazuje nasienniki przy kopulacji i wypuszcza zapłodnione jaja podczas składania.
Wydalanie: Wspólne otwarcie układu trawiennego, moczowego i rozrodczego – usuwa produkty przemiany (guano).
Magazynowanie nasienników: U niektórych gatunków kloaka samca magazynuje nasienniki dla dłuższej żywotności.
Gruczoły zapachowe: Niektóre gatunki mają przy kloace gruczoły wydzielające feromony do oznaczania terytorium lub przyciągania partnera.
Wydalanie soli: U niektórych ptaków morskich gruczoły soleń blisko kloaki regulują poziom soli i zapobiegają odwodnieniu.