Niszczenie siedliska: Główne zagrożenie dla oncilli to niszczenie jej naturalnego siedliska. Lasy, w których żyją oncille, są wycinane pod rolnictwo, wycinkę i inny rozwój. Gdy lasy znikają, oncille tracą domy, pożywienie i schronienie, i są zmuszane do przenoszenia się do innych obszarów, gdzie mogą nie przetrwać.
Braconierstwo i polowanie: Oncille są też polowane za futro, używane do odzieży i akcesoriów. Czasem są też zabijane na sport lub dlatego, że uważane są za szkodniki. Braconierstwo i polowanie mogą drastycznie zmniejszyć populację oncilli i utrudnić odbudowę gatunku.
Zmiany klimatyczne: Zmiany klimatu to też poważne zagrożenie dla oncilli. W miarę zmiany klimatu, siedlisko oncilli się zmienia, a one mogą nie być w stanie się do niego przystosować. Zmiany klimatu powodują też częstsze zjawiska skrajne, które niszczą siedlisko i utrudniają przetrwanie.