Los blastoporu
Protostomia: blastopór staje się ustami. Deuterostomia: blastopór staje się odbytem, drugie otwarcie – ustami.
Typ pękania
Protostomia: pękanie spiralne. Deuterostomia: pękanie promieniowe.
Los mezodermy
Protostomia: mezoderma z szczełkowania (schizocoelia). Deuterostomia: mezoderma z wybudowania (enterokoelia).
Powstanie celomu
Protostomia: celom ze szczełkowania. Deuterostomia: celom z wybudowania.
Przykłady
Protostomia: płaskoowady, okrągłowce, mięczaki, nóżkonogie. Deuterostomia: kolczystoskórne, pancerzowce, strunowce (w tym kręgowce).
Te różnice rozwojowe to fundamentalne cechy dzielenia zwierząt na te dwie główne gałęzie.