Selekcja hodowlana i hodowla genetyczna to w istocie synonimy. Oba terminy oznaczają wybieranie osobników z pożądanymi cechami do rozmnażania, przekazywanie tych cech do potomstwa i stopniową zmianę genotypu populacji przez pokolenia.
Wspólny cel: Obie dążą do poprawy pożądanych cech w populacji, np. wyższej wydajności mlecznej u krów lub szybszego wzrostu upraw.
Wspólna metoda: Obie polegają na selekcji osobników z pożądanymi cechami do rozmnażania, wykluczając te bez nich.
Wspólny wynik: Obie dają populację z wyższą częstotliwością pożądanych genów i bardziej pożądanym ogólnym wyglądem.
Choć terminy są zamienne, „hodowla genetyczna” czasem używa się w szerszym kontekście obejmującym bezpośrednią manipulację genami, np. inżynierię genetyczną, co niekoniecznie jest selekcją hodowlaną.
Dla tradycyjnych metod selekcji i hodowli organizmów z pożądanymi cechami, oba terminy są równoważne.