Krzyżowanie dwóch rodzeństwa guppy ogólnie nie jest zalecane. Choć część potomstwa może wydawać się zdrowa, istnieje znacznie wyższego ryzyka wad genetycznych, deformacji i problemów zdrowotnych.
Inbreeding zwiększa szansę, że potomstwo odziedziczy dwie kopie szkodliwych genów recesyjnych. Zmniejsza też różnorodność genetyczną, czyniąc mlode bardziej wrażliwymi na choroby i stres środowiskowy. Inbred guppy często wykazują zmniejszoną płodność, mniejszy rozmiar i wolniejszy wzrost.
Lepszym podejściem jest wybór niepokrewnych guppy z różnych linii lub hodowli. Jeśli rodzeństwo już zostało skrzyżowane, obserwuj mlode pod kątem deformacji i bądź gotowy do odrzucenia silnie dotkniętych osobników, by chronić zdrowie przyszłych pokoleń.