Oto kilka przykładów dowodów na istnienie skamieniałości przejściowych, które potwierdzają teorię ewolucji i rzucają światło na koncepcję brakujących ogniw:
1. Archeopteryks: Archeopteryks to pierzasty dinozaur, który żył około 150 milionów lat temu w okresie późnej jury. Uważany jest za skamielinę przejściową pomiędzy nieptasimi dinozaurami a współczesnymi ptakami. Archeopteryks miał cechy zarówno dinozaurów, takie jak długi kościsty ogon, jak i ptaków, takie jak pióra i skrzydła z pazurami.
2. Tiktaalik Roseae: Tiktaalik to ryba licząca 375 milionów lat, uważana za gatunek przejściowy między rybami a płazami. Miał rybie ciało i łuski, ale posiadał cechy umożliwiające poruszanie się na lądzie, takie jak mocne płetwy piersiowe z kościstymi kośćmi nadgarstków i zdolność oddychania powietrzem za pomocą płuc.
3. Mezoniks: Mezoniks to wymarły mięsożerny ssak, który żył około 55 milionów lat temu w epoce paleocenu. Uważa się, że jest to skamieniałość przejściowa pomiędzy przodkami współczesnych drapieżników (np. psów, kotów, niedźwiedzi) i parzystokopytnych (np. krów, świń, hipopotamów). Mezoniks miał psią czaszkę i zęby, ale posiadał pazury na nogach, podobne do tych spotykanych u niektórych parzystokopytnych.
4. Pośrednie skamieniałości wielorybów: Ewolucyjne przejście od ssaków lądowych do waleni całkowicie wodnych jest wspierane przez szereg skamieniałości przejściowych, w tym Pakicetus, Ambulocetus, Remingtonocetus i Basilosaurus. Skamieniałości te ukazują stopniowe adaptacje, które umożliwiły starożytnym wielorybom przemieszczanie się ze środowiska lądowego do wodnego, takie jak rozwój opływowych ciał, redukcja kończyn tylnych i ulepszone struktury pływające na kończynach przednich.
Przykłady te pokazują, że chociaż może nie być ani jednego brakującego ogniwa między dwiema określonymi grupami organizmów, istnieje wiele dowodów kopalnych potwierdzających koncepcję przejść ewolucyjnych i dostarczających cennych informacji na temat wzajemnych powiązań różnych gatunków w całej ich historii ewolucyjnej.