Małpy pająkowe są głównie polowane przez duże kotowate i drapieżne ptaki.
Jaguary, pumy, oceloty i mniejsze kotowate mogą polować na nie. Orły harpii są znane z polowania na małpy pająkowe. Duże węże jak boje i anakondy mogą celować w młode osobniki.
Małpy pająkowe są zwinne i żyją w grupach społecznych zapewniających ochronę, co sprawia, że są trudnym łupem dla większości drapieżników.