Wilki wschodnie są zagrożone z powodu:
- Utraty siedliska przez ekspansję miejską, rolnictwo, ścinanie drzew i rozwój
- Fragmentacji siedliska zmniejszającej różnorodność genetyczną
- Polowania i pułapkowania, często z powodu pomylenia z kojotami
- Konfliktów z ludźmi przez zwierzynę hodowlaną
- Konkurencji i hibrydyzacji z kojotami i innymi psowatymi
- Chorób, np. nosówki psiej
- Małej liczebności populacji
- Zmian klimatycznych wpływających na siedlisko i ofiary
- Niewystarczającej ochrony prawnej w niektórych regionach
Pilna ochrona siedlisk i zarządzanie ochronne są niezbędne do ich przetrwania.