Kojoty to niezwykle adaptywne i skuteczne drapieżniki, ale mają wrogów — zarówno naturalnych, jak i ludzkich:
Naturalni drapieżnicy:
- Wilki: W obszarach nakładających się zasięgi wilki polują na kojoty, zwłaszcza młode lub słabe osobniki.
- Niedźwiedzie: Nie są drapieżnikami bezpośrednimi, ale konkurują o pożywienie i zdarzają się zabić kojota.
- Pumy: W obszarach wspólnych pumy polują na kojoty, zwłaszcza młode i samotne.
- Rysie: Mniejsze od kojotów, ale konkurują o pożywienie i czasem polują na młode kojoty.
- Duże ptaki drapieżne: Orły złote i pułapki wielkie zdarzają się polować na kojoty, głównie młode.
Zagrożenia ludzkie:
- Polowanie i pułapkowanie: Kojoty polowane i łapane w pulapki w wielu regionach (kontrola populacji, ochrona zwierząt hodowlanych).
- Wypadki komunikacyjne: Częste ofiary samochodów, zwłaszcza w rejonach miejskich i podmiejskich.
- Choroby: Wścieklizna, distemper, ropnica wpływal na przeżycie.
- Utrata siedliska: Rozwój ziemi przez ludzi fragmentuje i niszczy siedliska.
Konkurencja o pożywienie:
- Inni drapieżnicy: Kojoty rywalizują z lisami, rysiami, a nawet psami domowymi o zasoby.
- Ludzie: Ludzie bywają konkurентem, zwłaszcza tam, gdzie kojoty adaptują się do żerowania w śmieciach.
Podsumowując: mimo dużej adaptywności i sukcesu, kojoty stoją przed szeregiem zagrożeń naturalnych i ludzkich.