Naturalne drapieżniki:
* Większe Canids: Wilki, szczególnie w obszarach, w których się pokrywają, mogą poluzować kojoty, szczególnie młode lub słabe osoby.
* niedźwiedzie: Chociaż nie jest bezpośrednim drapieżnikiem, niedźwiedzie mogą konkurować z kojotami o jedzenie i czasami je zabijać.
* Lwy górskie: Na obszarach, w których ich zasięg pokrywają się, lwy górskie mogą żeruj na kojotach, zwłaszcza młodych lub samotnych osobach.
* Bobcats: Bobcaty są mniejsze niż kojoty, ale mogą konkurować z nimi o jedzenie, a czasem żerują na młodych kojotach.
* duże ptaki ofiar: Złote Orły i wielkie rogate sowy mogą od czasu do czasu żerować na kojotach, zwłaszcza młodych.
Zagrożenia ludzkie:
* Polowanie i pułapkowanie: Kojoty są polowane i uwięzione w wielu obszarach, szczególnie w celu kontroli populacji lub w celu ochrony zwierząt gospodarskich.
* zderzenia pojazdów: Kojoty są często zabijane przez samochody, szczególnie na obszarach miejskich i podmiejskich.
* choroba: Kojoty są podatne na choroby takie jak wścieklizna, Distemper i Mange, które mogą wpłynąć na ich przetrwanie.
* utrata siedliska: Gdy ludzie nadal rozwijają ziemię, siedlisko kojotów jest rozdrobnione i niszczone, co utrudnia im rozwijanie się.
Konkurs na jedzenie:
* Inne drapieżniki: Kojoty konkurują z innymi drapieżnikami, takimi jak lisy, rysowniki, a nawet psy domowe, o zasoby żywności.
* Ludzie: Ludzie mogą być również źródłem konkurencji dla kojotów, szczególnie w obszarach, w których kojoty przystosowały się do oczyszczenia z powodu odpadów ludzkich.
Ogólnie rzecz biorąc, podczas gdy kojoty są wysoce elastyczne i odnoszące sukcesy drapieżniki, stoją w obliczu szeregu zagrożeń ze strony źródeł naturalnych i ludzkich.