Istnieją jednak pewne przypadki, w których mogą być ofiarą:
* Większe Canids: Wilki, niedźwiedzie, a nawet większe lwy górskie mogą poluzować kojoty, zwłaszcza młode lub osłabione osoby.
* Ludzie: Ludzie stanowią poważne zagrożenie dla kojotów poprzez polowanie, pułapki i niszczenie siedlisk.
* choroba: Kojoty mogą padać ofiarą chorób takich jak wścieklizna lub parwowirus, które mogą je osłabić i uczynić je bardziej podatnymi na drapieżnictwo.
Ogólnie rzecz biorąc, kojoty są zasadniczo bezpieczne przed drapieżnictwem ze względu na ich zdolność adaptacyjną, inteligencję i zachowanie opakowań. Bardziej prawdopodobne jest, że stanowią zagrożenie dla innych zwierząt niż na odwrót!