Kozica syberyjska jest zagrożona z kilku przyczyn:
- Braconnictwo: nielegalne polowanie na rogi, mięsko i skórę.
- Utrata siedliska: górnictwo, leśnictwo, infrastruktura i pasztowstwo degradują górzyste siedliska.
- Zmiany klimatu: zmiana roślinności wpływa na odżywianie i przetrwanie.
- Choroby: choroby przenoszone przez zwierzęta hodowlane lub pasożyty mogą zdzierać populacje.
- Ograniczona różnorodność genetyczna: małe, izolowane populacje zwiększają wrażliwość na wrodowe wady i zmiany środowiska.