Okres ciąży u koni morskich zależy od gatunku i może wynosić od 10 do 45 dni. Ogólnie, im większy gatunek, tym dłuższy okres ciąży. W trakcie ciąży samiec konia morskiego nosi rozwijające się zarodki w wyspecjalizowanej kieszeni brodawkowej na brzuchu. Zarodki otrzymują odżywkę z worka żółciowego do pełnego rozwoju. Po wylęciu młode konie morskie są swobodnie pływające i niezależne.