Konie morskie mają kilku drapieżników, w tym:
Kraby: Kraby to jeden z najczęstszych drapieżników koni morskich. Używają szczypiec, by złamać zbroję konia morskiego i zjeść miękkie tkanki.
Ryby: Wiele gatunków ryb, w tym tuńczyki, rybki mieczowe i rekiny, poluje na konie morskie. Te ryby są znacznie większe i silniejsze i mogą łatwo pokonać i zjeść konia morskiego.
Ptaki: Niektóre gatunki ptaków, jak mewy, rybitwy i pelikany, też polują i jedzą konie morskie. Używają ostrych dziobów, by przebić zbroję i dotrzeć do miękkich tkanków.
Ssaki morskie: Niektóre ssaki morskie, jak foki, lwy morskie i marswiny, znane są z polowania na konie morskie. Używają ostrych zębów, by zgnieść zbroję i zjeść miękkie tkanki.
Oprócz tych naturalnych drapieżników, konie morskie są też zagrożone działalnością ludzką: niszczeniem siedlisk, zanieczyszczeniami i nadmiernym rybołówstwem. Te czynniki przyczyniają się do spadku populacji koni morskich na całym świecie.