Bakterie mogą zachorować lub zabić ryby. W naturze zarówno ryby słodkowodne, jak i morskie chorują na choroby bakteryjne, a ryby akwariowe są jeszcze bardziej narażone. Uważliwy hodowca może zmniejszyć ryzyko odpowiednią opieką. Hodowcy ryb, rybacki i właściciele akwariów zyskują, ucząc się, które bakterie najczęściej chorują ryby.
Aeromonas
Kilka gatunków z rodzaju Aeromonas atakuje ryby. Aeromonas salmonicida wywołuje zakaźne wrzody wewnętrzne u łosi i troci, a nowe szepy sprawiają problemy innym rybom na Bałtyku (według Uniwersytetu w Floridzie i Oxford Journals). Inne gatunki powodują gnicie płetaw, często szkodząc rycom akwariowym. Niektóre bakterie Aeromonas mają whiplike flagella do poruszania się (Journal of Bacteriology).
Pseudomonas
Bakterie rodzaju Pseudomonas również powodują gnicie płetaw i wrzody wewnętrzne. Skutecznie przyczepiają się do tkanek ryb drobnymi włoskowatymi strukturami – fimbriami (National Center for Biotechnology Information).
Flexibacter
Flexibacter to patogen wywołujący guzy na skórze ryb. Jak sugeruje nazwa, jego struktura jest mniej sztywna niż u innych bakterii, a mimo braku flagell porusza się, giąc i skręcając ciałem. Flexibacter psychrophilus lubi zimną wodę (psychrophilus = kochający zimno). Ryby cieplnowodne zagraża Flexibacter columnaris (Massachusetts Office of Coastal Management).
Renibacterium
Prefiks „reni-” oznacza nerki. Renibacterium salmoninarum choruje nerki ryb (U.S. Geological Survey), czasem inne narządy.
Yersinia
Gatunek Yersinia pestis spowodował dżumę. Patogen ryb to Yersinia ruckeri – wywołuje krwawienia wewnętrzne i może być tak samo śmiertelny (National Center for Biotechnology Information). Choroba nazywa się „czerwonym piskiem”, bo ryba krwawi z pyska.
Mycobacterium i Vibrio
Oba rodzaje zawierają groźne patogeny ludzkie: Mycobacterium tuberculosis (gruźlica), Vibrio cholerae (cholera). Inne gatunki chorują ryby i mogą być śmiertelne (University of Florida).