Rybołówstwo może mieć efekty zarówno pozytywne, jak i negatywne. Selektywne łowienie może kontrolować gatunki inwazyjne, a złowienie dostarcza pożywienie i dochód. Zmniejszone populacje mogą wywołać kaskady troficzne zmieniające liczebność innych gatunków.
Efekty negatywne to przełowienie, przyłów gatunków niecelowych i uszkodzenia siedlisk przez narzędzia takie jak tryly. Potrzebne ostrożne zarządzanie, by korzyści przewyższały ryzyka.