Optymalny pH żołądka to silnie kwasowe środowisko, zazwyczaj 1–2. To kwasowanie aktywuje pepsynę – enzym rozkładający białka – i denaturuje białka, ułatwiając trawienie.
Niski pH pomaga też wchłaniać żelazo i witaminę B12 i chroni przed patogenami, zabijając większość bakterii. Żołądek chroni się warstwą śluzową i sekrecją wodorowęglanową.
Odchylenia od optymalnego pH (niskie lub brak kwasu) upośledzają trawienie i zwiększają ryzyko infekcji.