Kilka gatunków delfinów jest zagrożonych lub zagrożonych wyginięciem:
- Baiji: Uznany za funkcyjnie wyginęty w 2006 r.; żył w rzece Jangcyjiang w Chinach.
- Walifornia (vaquita): Krytycznie zagrożona w Zatoce Kalifornijskiej, zagrożona nielegalnym rybołówstwem i przyłowem.
- Delfin amazoński: Klasyfikowany jako wrażliwy przez degradację siedliska i nadmierne rybołówstwo.
- Marswina bezpłetwa czarnooskrzydła: Zagrożona w wodach przybrzeżnych i ujściach Azji.
- Delfin mroczny: Blisko zagrożony przez utratę siedliska, przyłów i zanieczyszczenia.
- Delfin Hectora: Zagrożony bliski Nowej Zelandii, dotknięty rybołówstwem i degradacją siedliska.
- Delfin południowy prawowalowy: Zagrożony w oceanach południowych wokół Antarktydy.
Działania ochronne dążą do ochrony tych gatunków i ich siedlisk.