Kilka ssaków morskich jest krytycznie rzadkich lub zagrożonych wyginięciem, stając przed zagrożeniami ze strony działalności człowieki i zmian środowiskowych.
Przykłady
Waquita: Mała marswinka żyjąca w Zatoczce Kalifornii, najbardziej zagrożony ssak morski na świecie – zostało ok. 10 osobników. Główne zagrożenia: nielegalne rybołówstwo i utrata siedliska.
Wał atlantycki północny: Z około 400 osobnikami, ten wieloryb wacikowy jest zagrożony zderzeniami ze statkami, zaplątaniem w sieciach rybackimi i utratą siedliska.
Wał południowy: Znajduje się w Oceanie Południowym, populacja ok. 10 000, wciąż zagrożony historycznym wałowictwem, zderzeniami i zaplątaniem.
Wał błękitny: Największe zwierzę ikiedy, do 30 m i 200 ton, zamieszkuje oceany na całym świecie, zagrożony wałowictwem i zderzeniami.
Wał płetwalowy: Drugie co do wielkości zwierzę, do 24 m i 100 ton, również zagrożony wałowictwem i zderzeniami ze statkami.