Polowanie: Szynszyle były polowane na swoje futro, które jest szczególnie miękkie i luksusowe. W XIX i na początku XX wieku skórki szynszyli były bardzo poszukiwane, a gatunek był prawie doprowadzony do wyginięcia. Chociaż polowanie na szynszyla zostało zakazane w większości krajów, nadal występuje nielegalnie.
Utrata siedliska: Szynszyle są przystosowane do życia w skalistym, górzystym terenie Andów. Jednak działalność człowieka zniszczyła lub zdegradowała większość ich naturalnego siedliska. W rezultacie szynszyle są obecnie uważane za gatunek zagrożony.
Zmiana klimatu: Zmiany klimatu grożą również szynszylami. Góry Andów doświadczają rosnących temperatur i zmian wzorów opadów, które zakłócają ekosystem i utrudniają przetrwanie szynszyli.