Polowanie i kłusownictwo: Od stuleci poluje się na kozicę apenińską ze względu na mięso, futro i poroże. Pomimo ochrony prawnej, nielegalne polowania i kłusownictwo nadal mają miejsce i stanowią poważne zagrożenie dla populacji kozic.
Konkurencja ze zwierzętami hodowlanymi: Zwierzęta gospodarskie, takie jak owce i kozy, konkurują z kozami o pożywienie i zasoby. Konkurencja ta może zmniejszyć zdolność kozic do przetrwania i rozmnażania, szczególnie podczas surowych zim, gdy brakuje pożywienia.
Choroba: Kozica apenińska jest podatna na różne choroby, w tym na robaki płucne, pryszczycę i brucelozę. Choroby te mogą szybko rozprzestrzeniać się wśród populacji kozic i powodować znaczną śmiertelność.
Zmiany klimatyczne: Zmiany klimatyczne powodują szybkie zmiany siedlisk kozic apenińskich. Rosnące temperatury i zmiany w rozkładzie opadów wpływają na roślinność i pokrywę śnieżną, utrudniając kozicom znalezienie pożywienia i schronienia.