Głównym powodem migracji nietoperzy ogonistych jest poszukiwanie bardziej sprzyjających warunków środowiskowych. Latem przebywają w północnej Meksyce i południowo-zachodnich USA, gdzie znajduje się obfitość pożywienia i miejsc do schronienia.
Z nadchodzeniem zimy pogoda w tych regionach staje się zbyt chłodna, by nietoperze przeżyły. Wędrują więc na południe – do Ameryki Środkowej i Południowej – gdzie znajdą więcej jedzenia i schronienia.