Lémury koczkodajowe stają przed zagrożeniami od:
- Fossa: Kotopodobny drapieżnik endemiczny dla Madagaskaru i główny drapieżnik lémurów.
- Harpagornis moorei: Wyginęły gigantyczny orzeł z Nowej Zelandii, kiedyś uważany za polującego na lémury.
- Cryptoprocta ferox: Inna nazwa fossy, największego drapieżnika Madagaskaru.
- Ludzie: Polowanie na futro, mięso, zwierzęta domowe, plus niszczenie siedliska przez drzewnictwo i rolnictwo.