Wyginięcie wynika z wielu czynników:
- Utrata i fragmentacja siedlisk przez wycinanie lasów, urbanizację, zanieczyszczenie.
- Zmiany klimatu szybsze niż zdolność adaptacji gatunków.
- Przeeksploatacja przez nieszrównoważone polowanie i rybołówstwo.
- Choroby wprowadzone do wrażliwych populacji.
- Gatunki inwazyjne wyparowujące lub drapieżne na rodzimych.
- Współwyginięcie gatunków ekologicznie zależnych.
- Konkurencja, drapieżnictwo, czynniki genetyczne, katastrofy naturalne.
Choć wyginiecie to proces naturalny, działalność ludzka przyspieszyła tempo wielokrotnie ponad poziom tła.