Króliki z miksomatozą rozwija objawy zależne od szczepu wirusa i osobnika.
Obrzęki: Charakterystyczne wokół głowy, twarzy, powiek, uszu – często z wydzieliną z oczu i nosa.
Zmiany skórne: Węzły lub wrzody na twarzy, uszach, ciele.
Problemy oddechowe: Kaszel, kichanie, wydzielina z nosa, czasem zapalenie płuc.
Problemy oczne: Obrzęki powiek, rogówka nieprzezroczysta, zapalenie spojówek.
Gorączka i apatia: Króliki są gorące, nieaktywne, tracą apetyt.
Śmierć: Często śmiertelne, zwłaszcza w populacjach dzikich – zgon w ciągu dni lub tygodni.