Szczury drzewne, znane też jako szczury drewne, mają szeroki wachlarz drapieżników.
Ssaki
- Kojoty
- Rysi
- Lisy (szara i rudą)
- Borsuki
- Lasice
- Waszony
- Koty domowe
Ptaki i gady
- Jastrzębie, w tym czerwonooki i Coopera
- Sowy, w tym puszyce i sowy wrzawy
- Węże, zwłaszcza dzięcioły
Ludzie również wpływają na populacje szczurów drzewnych przez polowanie, pułapki i niszczenie siedlisk. Konkretni drapieżnicy zależą od lokalizacji i czynników środowiskowych.