Istnieje jednak kilka wyjątków:
* większe krokodyle: Większe krokodyle ze słoną wodą czasami żerują na mniejszych osobach własnych gatunków, zwłaszcza dla młodych. Jest to znane jako kanibalizm.
* duże węże: Niektóre bardzo duże węże, takie jak siatkowe pithony, znane są z zabijania i konsumpcji młodych krokodyli ze słoną wodą.
* inne drapieżniki wierzchołkowe: W rzadkich przypadkach rekiny, zwłaszcza duże rekiny byków, mogą żerować na młodych krokodylach, szczególnie w środowiskach ujściowych.
Należy zauważyć, że te przypadki są rzadkie, a zdecydowana większość krokodyli ze słoną wodą umiera z powodu naturalnych przyczyn, takich jak choroba lub starość.
Istnieje również możliwość interwencji człowieka. Na przykład niektóre osoby polują na krokodyle, chociaż jest to często ograniczone lub regulowane.