Grypa ptasia (influenza owia) może poważnie zakłócić układ odpornościowy ptaka. Wirus szybko replikuje się w drodze oddechowej i innych narządach, rozprzestrzeniając się po całym ciele.
Może poddawać funkcje odpornościowe, czyniąc ptaki bardziej podatnymi na infekcje wtórne. Przypadki ciężkie często wiążą się z uszkodzeniem układu oddechowego, zaangażowaniem układowym narządów i w niektórych przypadkach niebezpieczną nadreakcją zwaną burzą cytokinową.
Wirus może też powodować immunopatologię – uszkodzenia tkanek wywołane przez odpowiedź odpornościową samą w sobie – a niektóre szczepy potrafią w ogóle unikać wykrycia przez układ odpornościowy.
Zrozumienie tych wpływów jest kluczowe dla opracowania skutecznej kontroli chorób i ochrony populacji ptaków.