Pióra pingwina cesarskiego nie są tłuste. Mają trzy warstwy: krótką, sztywną czarną warstwę zewnętrzną, dłuższą, puchową warstwę środkową i warstwę tłuszczu podskórnego. Pióra są stale czyszczone i wymieniane, by pozostały wodoodporne i izolujące przed antarktycznym zimnem.