Modrzewie górskie są narażone na drapieżnictwo wielu zwierząt, w tym:
- Ptaki drapieżne: jastrzębie i sokoły
- Sowy
- Węże
- Wiewiórki
- Chomiki
- Sojki
- Sroki
- Szpaki
- Wróbla domowe
- Gracki
Ci drapieżnicy mogą polować na modrzewie górskie, a także na ich jajka i młode. Aby zredukować ryzyko, modrzewie górskie często wybierają miejsca gniazdowe w dołkach lub szczelinach.