Jest jednak kilka rzeczy, które mogą im zagrozić:
* Większe ptaki ofiary: Chociaż nie będą aktywnie polować na fregaty ptaki, duże ptaki, takie jak orły lub jastrzębie, mogą potencjalnie żerować na pisklętach lub osłabionych osobach.
* Ludzie: Aktywność człowieka, w tym utrata siedlisk, zanieczyszczenie i łowia rybacka, może stanowić zagrożenie dla populacji fregaty.
* pasożyty: Fragment ptaków mogą mieć wpływ różne pasożyty, takie jak roztocza, wszy i robaki jelitowe.
* burze i pogoda: Ekstremalne zdarzenia pogodowe mogą prowadzić do obrażeń lub śmierci.
Ogólnie rzecz biorąc, fregatebirds są bardzo dobrze przystosowane do swojego środowiska i mają niewiele naturalnych drapieżników. Ich główne zagrożenia pochodzą z działalności człowieka i okazjonalnego oportunistycznego drapieżnika.