Muchy domowe składają jaja w partiach po około 100 co kilka dni. W zależności od gatunku samica muchy może złożyć do 1000 jaj w życiu. Jaja są białe i mają około 1 mm długości, zazwyczaj złożone na wilgotnej materii organicznej, takiej jak śmieci, nawóz lub martwe zwierzęta. Wylęgują się one w larwy, czyli robaki, w ciągu około 24–36 godzin.